L'Audi Sport Quattro S1 E2 a été introduite fin 1985 en tant que mise à jour de l'Audi Sport Quattro S1. La voiture était équipée d' un moteur 5 cylindres en ligne qui déplaçait 2110 cm3 (128,8 pouces cubes) et générait une puissance de sortie officiellement indiquée de 480 ch. Cependant, le turbocompresseur a utilisé un système d'air de re-circulation, dans le but de maintenir l'unité en rotation à haut régime, lorsque le conducteur a fermé l'accélérateur, soit pour reculer dans les virages, soit lors des changements de vitesse. Cela a permis au moteur de reprendre sa pleine puissance immédiatement après la reprise des pleins gaz, réduisant ainsi le décalage du turbo . La puissance réelle dépassait 507 ch à 8 000 tr/min.
En plus de la puissance améliorée, un kit aérodynamique agressif a été ajouté, il comportait des ailes et des spoilers très distinctifs à l'avant et à l'arrière de la voiture pour augmenter la force d'appui. Le poids a été réduit à 1 090 kg. Le S1 pourrait accélérer de 0 à 100 km / h en 3,1 secondes. Certaines des voitures ont été fournies avec une boîte de vitesse "Power-shift", un précurseur de la technologie DSG .
La S1 E2 a fait ses débuts au Rallye d'Argentine de 1985, avec Blomqvist au volant. Cette variante a été couronnée de succès dans le circuit de rallye, Röhrl et Christian Geistdörfer remportant le rallye de San Remo en 1985 . Une version modifiée de l'E2, a également été pilotée par Michèle Mouton.
La S1 E2 deviendra la dernière voiture du groupe B produite par Audi , l'équipe d'usine se retirant du championnat après le rallye de 1986 au Portugal. Les voitures d'usine finales de 1986 étaient évaluées à 600 PS (441 kW - 592 ch). En 1987, la voiture a remporté le Pikes Peak International Hill Climb conduit par Walter Röhrl.