L'EB110 Supersport (appelée Sport Stradale dans certaines publicités Bugatti) est la version la plus radicale de l'EB110 : allégement du poids total, moteur 610 ch et définition ultra sportive du châssis et des suspensions. Les détails extérieurs sont spécifiques à la version Supersport : aile à air fixe (inclinaison réglable manuellement), 5 trous d'entrée d'air latéraux au lieu de la fenêtre latérale (premiers prototypes à 7 trous), jantes Type 55, aération de refroidissement des freins située derrière les roues avant, pare-choc avant plus agressif avec une lame aérodynamique à la base. L'intérieur est également allégé avec un tunnel de transmission et des portes simplifiées, 2 sièges Recaro, vitres manuelles...etc.
Une évolution spéciale du moteur de la SS a été proposée, les spécifications "Le Mans" : 700 ch, système de suralimentation réglable contrôlé par le cockpit. Il semble que seulement 3 modèles ont été équipés de cette option, probablement en après-vente.
La période de production de l'EB110 SS a été très courte en raison d'une longue période d'installation et de la faillite de la fin de 1993 au milieu de l'année 1995. Le nombre SS est d'environ 30 modèles (officieusement 31, 33 inscrits au registre).