La version Diablo GT a été montrée pour la première fois au Salon de l'Automobile de Genève, avec une édition limitée à 80 exemplaires. Cette voiture était capable d'atteindre la vitesse maximale de 338 km/h.

La version GT-R, elle, a été dévoilée lors du salon de Bologne en 1999. Cette voiture est préparée dans le but d'être une voiture de course. La production de la Diablo GTR sera limitée à seulement 30 unités, mais cette voiture était prête à être pilotée par quelques pilotes de la Lamborghini Supertrophy.

La Diablo GTR était, en fait, le véritable successeur de la Diablo SVR qui a été utilisée pendant quatre années consécutives avec beaucoup de succès comme une véritable voiture de course dans le Lamborghini Supertrophy. 

La vitesse maximale de cette GTR a été fixée à 348 km/h. Le moteur V-12 de 6 litres développe désormais 590 ch au lieu des 575 ch de série de la Diablo GT.

La puissance de ce magnifique V-12 a été obtenue par l'utilisation d'un collecteur d'admission à plusieurs papillons avec un système d'admission individuel, un système de distribution variable des soupapes d'admission, un système de conduits d'admission dynamique en amont du plénum d'admission et des bielles en titane couplé à un vilebrequin allégé. 

Des systèmes de refroidissement supplémentaires ont été montés pour l'huile de boîte de vitesses et l'huile différentielle afin de répondre aux exigences plus élevées d'un moteur V-12 de course.

Les jantes massives monobloc en magnésium léger de 18 pouces de diamètre sont équipées d'un mécanisme de verrouillage central monobloc de type course avec un boulon de 85 mm. Ces roues ont été conçues pour accepter les pneus standard et les pneus de course de Pirelli.

Les freins ont reçu des étriers de course spéciaux pour répondre à l'augmentation de puissance, presque tout le corps de cette GTR était en fibre de carbone, seul le toit est resté en acier pour la résistance à la torsion tandis que les deux portes ont été conservées en aluminium pour des raisons de sécurité.

A l'intérieur, la Diablo GTR a également été dépouillée de tout ce qui n'était pas nécessaire, la climatisation a été supprimée tandis que le siège passager a été retiré, le siège du conducteur était désormais un siège baquet en fibre de carbone léger avec un harnais de sécurité six points, également parce que ce siège était plus large que les sièges originaux de la GT, le tunnel central de transmission a été réduit. Les boutons standard ont été remplacés par des interrupteurs de course, tandis qu'un système d'extinction d'incendie obligatoire de Momo a été monté sur le côté droit du cockpit avec la possibilité de l'allumer avec un bouton situé dans le tunnel central. 

Pour perdre encore plus de poids, les vitres latérales ont été remplacées par des vitres en plexiglas, intégrant une petite partie coulissante. Le toit et les portes sont en alliage d'aluminium, tout le reste de la carrosserie est en carbone. L'aileron arrière est directement boulonné sur le châssis pour un meilleur appui.

Le capot avant est désormais retenu par des clips à ouverture rapide tandis que la géométrie de la suspension a été modifiée pour permettre à la GTR d'être encore plus proche de la chaussée que la Diablo GT originale. Juste devant le pare-brise, un interrupteur d'arrêt d'urgence a été monté, qui coupe l'alimentation des pompes à carburant et l'allumage en cas d'accident.