En milieu d'année 1961, la deuxième version de la Lotus Seven Series 2 sort. Le moteur Ford 105E a été remplacé par le moteur Ford 109E, le même que celui installé sur la berline de Ford, la Ford Consul Capri.
Ce moteur développe une puissance de 1340 cm3. Le principal problème de cette version est l'essieu arrière qui pouvait bloquer le différentiel de manière à ce que la voiture soit un peu instable.
Toutefois, cette version de voiture est apparue dans la série "Le Prisonnier" en tant que voiture principale de l'Agent nommé "Numéro 6".