Construite comme une voiture de test et de développement fin 1967, Matra prépare simultanément le Championnat de Formule 1 et de Formule 2. La Matra MS9 est conçue de manière à pouvoir recevoir plusieurs types de moteur. La première Formule 1 sera elle prête à accueillir un V8 Cosworth, puis le fameux V12 Matra de 3L. L'objectif est de pouvoir préparer l'avenir, la MS9 servant de base aux futurs MS10 et MS11.

La Matra MS9 n'a couru qu'une seule fois, lorsque Jackie Stewart l'a conduite au GP d'Afrique du Sud de 1968. Avant le prochain GP, Matra l'a remplacé par le Matra MS10 spécialement conçu.Ken Tyrrell s'était joint pour la première fois à la Matra lorsqu'il avait piloté des Matra MS5 en Formule 2 avec des moteurs BRM P80 en 1966, la dernière saison de la Formule 2 d'un litre. Jackie Stewart et Jacky Ickx étaient les pilotes. Pour 1967, les MS5 monocoques soignés étaient équipés de moteurs Cosworth FVA, puis les MS7 ont été introduits à la mi-saison, date à laquelle Stewart est devenu un vainqueur de la course régulière. Cet été aussi, le moteur Cosworth DFV F1 est apparu pour la première fois, et Stewart, qui perdait déjà confiance dans les moteurs H16 F1 trop compliqués de BRM, était très désireux d'avoir la puissance DFV en 1968. Il ne pouvait pas l'avoir chez BRM, mais il le pourrait si lui et Ken Tyrrell formaient une équipe de F1 ensemble. Tyrrell a rapidement négocié un accord avec Ford pour obtenir des DFV pour 1968, puis a approché Matra. Avec l'un des meilleurs pilotes au monde,

Il y avait peu de temps avant le début de la saison 1968, Matra a donc construit une voiture de test et de développement utilisant un châssis MS7 modifié et équipée d'un Cosworth DFV. Le MS9 résultant était un monocoque assez orthodoxe avec deux pontons reliés à la pédale, par une cloison de tableau de bord et par une autre cloison derrière le conducteur. Un cadre tubulaire continuait vers l'arrière pour contenir le moteur, car le MS9 avait initialement été conçu pour tester une variété de moteurs. Le moteur Cosworth DFV était boulonné à la cloison arrière et traversait une boîte de vitesses Hewland DG300. La suspension avant était le long des lignes Lotus 49 avec des culbuteurs et des ressorts intérieurs; des ressorts extérieurs ont été utilisés à l'arrière. Les montants et les moyeux faisaient partie de la gamme de voitures de sport MS630 de Matra. En tant que voiture d'essai, elle n'avait pas une pleine capacité de carburant. La voiture a été achevée le 18 décembre, et testé brièvement à Montlhéry avant d'être envoyé en Afrique du Sud pour le Grand Prix le 2 janvier 1968. Telle était la ruée, elle était encore peinte en apprêt vert à son arrivée, et sa laideur verte fut bientôt compensée par la nécessité d'un sur-dimensionné radiateur avant, et un réservoir d'eau supplémentaire et un refroidisseur. Malgré tout, Stewart a terminé deuxième le plus rapide lors de la première séance d'essais et a pris le troisième rang sur la grille. Il a couru deuxième derrière le Lotus 49 de Jim Clark, mais une bielle cassée l'a mis hors circuit après 38 tours. Stewart a terminé deuxième le plus rapide lors de la première séance d'essais et a pris le troisième rang sur la grille. Il a couru deuxième derrière le Lotus 49 de Jim Clark, mais une bielle cassée l'a mis hors circuit après 38 tours. Stewart a terminé deuxième le plus rapide lors de la première séance d'essais et a pris le troisième rang sur la grille. Il a couru deuxième derrière le Lotus 49 de Jim Clark, mais une bielle cassée l'a mis hors circuit après 38 tours.

Le MS9 n'a été utilisé qu'une fois de plus, pour une session de test à Albi, avant d'être mis de côté. Elle est réapparue plusieurs années plus tard lorsqu'elle a été restaurée par Antic Auto Racing de Didier Castello à Gonfaron, France en 1992 et 1993. En 1998, elle était exposée au Manoir de l'Automobile, au Lohéac, Bretagne, musée Michel Hommell. Entre 2005 et 2007, il a rejoint la collection de Matras d'Abba Kogan et a été restauré dans la livrée verte dans laquelle il a couru. Il est ensuite resté exposé au Donington Museum jusqu'à fin 2013.