Les Porsche 959 Prototype sont les premières 959 produites et les plus rares. Seulement douze exemplaires prototypes ont été produits par le constructeur de Stuttgart à des fins de développement. Ces modèles, connus sous l'appellation « F-series », ont été assemblés avant les modèles « V-series » (pré-production) et « N-series » (véhicules pilotes).
Aujourd'hui, il ne reste que quatre exemplaires encore existants des « F-series ». Les douze prototypes « F-series » étaient tous différents les uns des autres : équipements, carrosseries, couleurs, mécaniques etc...
En 2018, l'un d'entre eux, le prototype F4, fut vendu lors d'une vente RM Sotheby's pour la somme d'un million de dollars. Ce dernier fut l'un des deux prototypes arborant la teinte "Ruby Red". Il se distingue par la présence d'entrées d'air situées sur les ailes arrières, inexistantes sur le second prototype de la même teinte.